液相色譜在基本原理上與氣相色譜儀一致，因此設備的基本原理相似，但在測試方面不同。
地點不同，但還有另一點。液相色譜與氣相色譜的主要區別如下：
1.注入方式的差異：液相色譜法只要將樣品制成溶液，氣相色譜就需要加熱氣化或分解。
2、流動上的差異，測試的組和流動相之間，流動相和固定相之間都存在差不多的相互作用力。
3.由于液體的粘度比氣體大兩個階段，被測試的組分在液體流動上的擴散系數比氣體流動相小約4~5個。
5、液相色譜法采用5~10Lm微細粒子固定相，使流體相在色覺上滲透率大大降低，流動阻力增加，需要利用高壓泵運輸流動相。
6、液相色譜在液相進行，測定成分的檢測一般是紫外線探測器，
差分折射探測器、熒光光度探測器等；
7、與液相色譜和氣相色譜相比，液相色譜也具有高靈敏度、高性能、高速度的特點。8、液相色譜定性和定量分析，與氣相色譜分析相似，定性分析，保存價值定性或使用其他定性能力。
使用工具分析方法；定量分析中使用了測定峰面積的歸一化、內標法、外標法等，但液相色譜分離復雜。
在進行分組風格時，一些分組組往往不能出氣相色譜儀高值，因此標準化的法定量受到限制，內標法定量被廣泛使用。
